UK Оцінка ефективності показників інформативності ISSR-маркерів для аналізу генетичного поліморфізму рослин

##plugins.themes.bootstrap3.article.main##

Мар’яна Зіновіївна Прокоп’як
Адріана Ігорівна Флячок
Оксана Юріївна Майорова
Людмила Русланівна Грицак
Надія Михайлівна Дробик

Анотація

Оцінено інформативність ISSR-маркерів і продемонстровано їх ефективність для
оцінки генетичного різноманіття рослин з семи популяцій Gentiana lutea L. з Українських
Карпат. За усіма показниками (ЗКА, КПА, PIC, MI, Rp, D) найбільш інформативними були
UBC#811, UBC#807, а найменш – UBC#827 і UBC#889. Відношення між усіма параметрами
оцінки ефективності праймерів характеризувалося високим рівнем достовірності (р<0,001,
р=0,05), лише у деяких випадках воно було вищим, ніж 5 %. Оцінено рівень генетичного
поліморфізму G. lutea за UBC#807, UBC#811 і UBC#840.

##plugins.themes.bootstrap3.article.details##

Розділ
Статті
Біографії авторів

Мар’яна Зіновіївна Прокоп’як , Тернопільський національний педагогічний університет імені В. Гнатюка

кандидат біологічних наук, доцент
Тернопільський національний педагогічний
університет імені В. Гнатюка

Адріана Ігорівна Флячок , Тернопільський національний педагогічний університет імені В. Гнатюка

магістрантка хіміко-біологічного факультету
Тернопільський національний педагогічний
університет імені В. Гнатюка

Оксана Юріївна Майорова , Тернопільський національний педагогічний університет імені В. Гнатюка

кандидат біологічних наук, викладач
Тернопільський національний педагогічний
університет імені В. Гнатюка

Людмила Русланівна Грицак, Тернопільський національний педагогічний університет імені В. Гнатюка

доктор біологічних наук, професор
Тернопільський національний педагогічний
університет імені В. Гнатюка

Надія Михайлівна Дробик , Тернопільський національний педагогічний університет імені В. Гнатюка

доктор біологічних наук, професор
Тернопільський національний педагогічний
університет імені В. Гнатюка

Посилання

Сиволап Ю.М. Геном рослин і «молекулярна селекція». Селекція і насінництво. 2008. Т. 96. С. 34–42.

Misra A., Shasany A.K., Shukla A.K. et al. AFLP markers for identification Swertia species (Gentianaceae).

Genetics and Molecular Research. 2010. Vol. 9 (3). P. 1535–1544.

Mondini L., Noorani A., Pagnotta M.A. Assessing plant genetic diversity by molecular tools. Diversity. 2009.

Vol. 1. P. 19–35.

Чесноков Ю.В., Артемьева А.М. Оценка меры информационного полиморфизма генетического

разнообразия. Сельскохозяйственная биология. 2015. Т. 50, № 5. С. 571–578.

Amiryousefi A., Hyvönen J., Poczai P. iMEC: Online Marker Efficiency Calculator. Applications in Plant

Sciences. 2018. Vol. 6 (6). e1159.

Powell W., Morgante M., Andre C., Hanfey M., Vogel J., Tingey S., Rafalski A. The comparison of RFLP,

RAPD, AFLP and SSR (microsatellite) markers for germplasm analysis. Mol. Breeding. 1996. 2. P. 225–228.

Prevost A., Wilkinson M.J. A new system of comparing PCR primers applied to ISSR fingerprinting of potato

cultivars. Theor. Appl. Genet. 1999. 98. P. 107–112.

Tessier C., David J., This P., Boursiquot J.M., Charrier A. Optimization of the choice of molecular markers for

varietal identification in Vitis vinifera L. Theor. Appl. Genet. 1999. 98. P. 171–177.

Rogers S.O., Bendich A.J. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh herbarium and mummified plant

tissues. Plant Mol. Biol. 1985. Vol. 5. P. 69–76.

Спірідонова К.В. Вивчення особливостей геномної мінливості культивованих клітин раувольфії зміїної

Rauwolfia serpentina Benth : дис...канд. біол. наук: 03.00.15. Київ, 2000. 149 с.

Mosula M.Z., Konvalyuk I.I., Mel’nyk V.M., Drobyk N.M., Tsaryk Y.V., Nesteruk Yu.Y., Kunakh V.A. Genetic

polymorphism of Gentiana lutea L. (Gentianaceae) populations from the Chornohora ridge of the Ukrainian

Carpathians. Cytology and Genetics. 2014. Vol. 48, № 6. P. 371–377. Doi: 10.3103/S0095452714060073.

Андрєєв І.О., Мосула М.З., Мельник В.М., Бублик О.М., Конвалюк І.І., Дробик Н.М. Порівняння

показників інформативності ПЛР-маркерів для аналізу генетичного різноманіття на прикладі Gentiana

lutea L. Фактори експериментальної еволюції організмів. 2014. Т. 14. С. 141–146.

Saini M., Singh S., Hussain Z. et al. RAPD analysis in mungbean [Vigna radiata (L.) Wilczek.] II: A comparison

of efficiency parameters of RAPD primers. Indian J. Biotechnol. 2010. Vol. 9. P. 276–282